Organizacje to zrzeszenia shinobi, których łączy wspólny cel.
Na świecie istnieje wiele ugrupowań, o celach bardziej lub mnie złożonych, a każda z nich rządzi się własnymi prawami, które ustala zwykle lider.
Organizacje działają zwykle pod patronem wioski, na której terenie się znajdują. Istnieją jednak grupy niezależne, a nawet przestępcze.
Każda organizacja ma jednak swoje cele, które z biegiem czasu mogą ulec zmianie, jeśli będą ku temu podstawy.
Ugrupowania mogą stworzyć swoją siedzibę w dowolnej lokacji, a przynależność do organizacji często niesie za sobą przywileje w świecie shinobi.

Wymagania Stworzenia Organizacji:

- Aprobata Wioski(Kage/ANBU/itp) [O ile ugrupowanie przynależy do wioski]
- Gotowość do poniesienia konsekwencji swoich działań
- Akceptacja Administracji

Wzór Zgłoszenia Organizacji:

Nazwa: [Nazwa Organizacji]
Cel Główny: [Długoterminowy, najważniejszy cel Ugrupowania]
Cele Poboczne: [Krótkoterminowe cele niezależne od celu głównego]
Geneza: [Szczegółowy opis genezy, a także okoliczności powstania]

Zgłoszenie Organizacji odbywa się poprzez założenie nowego wątku w tym oto dziale.
Przy Tworzeniu Organizacji można wykorzystać komendę HIDE, o ile założyciel sobie tego życzy.